负责组织完成GECM卫星工程项目总体方案设计，各工程系统间技术协调，并协调开展系统间接口对接试验。 

　　卫星系统总体单位：中国科学院微小卫星创新研究。 

　　负责卫星系统研制，实现卫星正常在轨运行，完成科学探测数据的获取并传送至地面。其中有效载荷由中国科学院高能物理研究所负责研制。 

　　运载火箭系统：航天科技集团有限公司第一研究院。 

　　负责运载火箭系统研制生产任务，在发射场系统、测控系统支持下将卫星准确送入预定轨道。 

　　地面支撑系统总体单位：中国科学院国家空间科学中心。 

　　负责地面支撑系统研制和建设，完成有效载荷在轨运行和科学探测任务的实施，完成科学数据的接收、预处理、管理和归档，提供数据长期发布服务。其中科学数据的地面接收由中国科学院空天信息创新研究院负责。 

　　科学应用系统总体单位：中国科学院高能物理研究所。 

　　负责科学应用系统的研制建设和运行，完成科学观测计划制定、指导科学探测任务的实施，负责有关科学数据的处理、研究工作，参与数据发布，提供科学用户支持。